El origen de
Valsequillo data del siglo XV, cuando los habitantes de
Fuente Obejuna se dispersaron a causa de los desmanes del comendador. Junto a esta población nacieron otras cinco que acabaron por formar el municipio de las Cinco Aldeas. En el siglo pasado se emanciparon de Fuente Obejuna, separándose más tarde en municipios independientes. En el libro de Montería de Alfonso XI se describen los parajes de este
pueblo como zona de transito entre Gahete, Fuente Obejuna y
Bélmez. Hay que esperar al año 1.569 para encontrar la primera alusión al núcleo de población con su nombre. Valsequillo tuvo un duro castigo durante la guerra civil, sufriendo la destrucción de gran parte de su patrimonio
artístico y cultural. Del expolio no se salvaron ni el archivo municipal ni el parroquial. Con la destrucción de dichos archivos, especialmente la municipal, la villa de Valsequillo se encontró con importantes
lagunas en su
historia local.