En el siglo XVII sería cuando Algarinejo alcanzaría su condición de municipio, concretamente en 1614, cuando Mateo de Lisón y Biedma lo compra por 3200 ducados al Rey Felipe III y convirtiendo la localidad en la joya de su marquesado. En esta fecha el cortijo de Algarinejo, pues apenas contaba con alguna que otra casa, estaba habitado por 117 personas contando desde 1578 con una iglesia y personajes de importancia como un alguacil, regidor y sacristán. Actualmente, y desde 1779, Algarinejo cuenta con una maravillosa e inmensa iglesia edificada según cuenta la leyenda (vease monumentos de Algarinejo), tras el cumplimiento de una promesa. En fechas posteriores Algarinejo fue de nuevo vendido (ya con una población de 387 habitantes) al nieto de Mateo de Lisón. Durante el último cuarto del siglo XVII hubo una epidemia de peste negra en España, asolando tierras de Murcia y Granada, milagrosamente Algarinejo se libró de la epidemia, aunque inesperadamente hubo alguna que otra muerte en la fecha de 1680 por los varios terremotos que consternaron al municipio, y la sequía. Fue justamente ese año cuando San Dionisio de Areopajita se eligió Patrono, para acompañar a Santa Ana.