Limita al norte con
Villablanca, mediante el
pinar del Marquesado. Al este con el municipio de
Lepe; entre la Marruza, la urbanización Las Colinas y el límite entre
Islantilla y
La Antilla. Al oeste con el término de
Ayamonte, siendo límites naturales la ría Carreras y el estero de Tamujar Grande y la urbanización Villa Antonia junto a la
carretera y El Empalme, salvo una porción de terreno rústico en la margen oeste entre dicha carretera y la nacional y hasta las inmediaciones del
parque de bomberos de la Costa, ya en el término municipal de Villablanca. Todo el frente sur del municipio linda con el océano Atlántico. El punto más alto del municipio se encuentra junto al punto kilométrico 123.500 de la A-49, a unos 66 metros de altura sobre el nivel del
mar medio en
Alicante y el más bajo se localiza en la ría Carreras debido a las corrientes que se forman en su bocana. Existen 8 núcleos principales, uno de los cuales es la cabeza del municipio (
Isla Cristina) y otro es una entidad local autónoma (
La Redondela) por sus condicionantes históricos, ya que fue un municipio hasta 1887, entre ambos aglutinan a más del 95% de la población. Existe un noveno núcleo, el de Monterreina, que se considera suburbanizado debido a una promoción urbanística que no prosperó en los años 1970 y actualmente está calificado como terreno rústico. En los últimos años, con la escasez de suelo urbanizable de la ciudad de Isla Cristina, se están desarrollando nuevas urbanizaciones residenciales a modo de ciudad dormitorio en el cercano núcleo de
Pozo del Camino, que aglutina una población de unos 1.300 habitantes en su redor.