En 1594 formaba parte del reino de
Sevilla en la Mitación de
San Juan y contaba con 285 vecinos pecheros. 1 Sobre la etimología de su nombre actual existen varias versiones, entre las que destacan una proveniente de la abundancia de esta planta (hinojo) en su término, así como una versión histórica. En esta última se relata como el rey Alfonso X "el Sabio" se postró de
hinojos ante la patrona del
pueblo, una vez fue reconquistado, dándole así su nombre actual.
Según la leyenda, el rey Alfonso X El Sabio se postró de hinojos (de rodillas) ante la Patrona de la
Virgen del
Valle. De la época
romana aún quedan vestigios que han sido encontrados en edificaciones y obras realizadas en las cercanías del pueblo, especialmente en la Alameda de Alquería y del Aljarafe. Esta villa pertenecía en tiempos antiguos al Condado de
Niebla y posteriormente a la provincia de Sevilla en tiempos del Rey San Fernando. Fue Isabel II quien cambió el pueblo a la provincia de
Huelva, a la vez que el pueblo de
Carrión de los Céspedes pasó de Huelva a Sevilla. En las obras de ampliación de la
carretera, realizadas hace algunos años, se han encontrado algunos restos de
cerámicas que corroboran la existencia de anteriores asentamientos así como determinadas actividades artesanales. La antigua pertenencia de Hinojos a Sevilla es representada en su
escudo municipal mediante el No8Do o armas menores de la capital del Guadalquivir ('Empresas simbólicas de Hinojos. Vexilología. Sigilografía. Heráldica', de Juan José Antequera Luengo, Sevilla, Facediciones, 2008).
El nombre de Hinojos, según creo recordar, ya existía en los tiempos de Roma, bajo el nombre de Omnius.
El origen de la
Semana Santa Hinojera lo tiene la Primitiva Hermandad Local de Penitencia y Pontificia Archicofradia del triunfo de la Santa
Cruz, Santisimo
Cristo de la Vera Cruz o Sangre de nuestro Señor Jesucristo Y Maria Santísima de la Esperanza, Divina Pastora de las Almas.
Entre las
Fiestas Primitivas del pueblo estan el Jueves
Santo (Semana Santa, la
Fiesta mas antigua), la
Romeria del Romerito (desde el siglo XV, se celebraba solo con la Cruz), el
Corpus, fiesta muy antigua tambien, asi como las Fiestas a la Patrona. Desde la
antigüedad el pueblo rinde honores el dia tres de Mayo a la Santa Cruz con un Triduo.
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Semana Santa, de gran interés, destaca sobre todo "Los Abrazos", en mayo, 
Casas rurales "Los Pinos", junto al Centro de Visitantes del Parque Nacional de Doñana, llamado "Los Centenales". Una empresa "Doñana Nature" realiza rutas por la zona norte del Parque Nacional de Doñana.
