Etapa guanche: La zona donde se asienta el municipio se encuentra habitada desde época guanche, tal y como demuestran los hallazgos arqueológicos encontrados por toda su superficie. El territorio formaba parte de los reinos o menceyatos de Taoro e Icod, estando separados por el barranco de la Chaurera. Una vez culminada la conquista de la isla en 1496, el nuevo gobernador Alonso Fernández de
Lugo comenzó con los repartimientos de tierras y bienes entre conquistadores y colonos. En la zona del casco de
San Juan se instaló a principios del siglo el colono portugués Martín Rodríguez, quien levantó hacia 1530 una
ermita en honor a San Juan Bautista. En torno a la ermita se van estableciendo muchos de los descendientes de Martín Rodríguez y otras
familias que acudían a la zona atraídos por la calidad agrícola de sus tierras y la suavidad del clima. Poco a poco y de manera progresiva, fue creándose el
pueblo en torno al
Camino Real.