La iglesia de Setcases, dedicada a San Miguel Arcángel, data de finales del siglo XVII. El año 1692, que figura al pie del basamento del altar mayor, puede ser la fecha de la terminación de la carpintería, y el año 1706, que figura en una de las piezas de este altar, la de la su definitiva construcción. Ahora bien, un incendio ocurrido en 1728 hundió el tejado y la primitiva vuelta (de madera), y destruyó la portada. Su reconstrucción se terminó en 1729.

Fue construida sobre una iglesia de estilo románico, edificada en el siglo XII, una vez finalizada la organización religiosa de la Vall de Camprodon. De esta última, quedan restos del presbiterio, que aparece exactamente en la base de la actual campanario, y también algunas piedras utilizadas en su construcción.

Restaurada en 1729, se trataría pues de una edificación que, pasada la época gótica, aunque conserva las fórmulas constructivas como son las ojivas o nervios de sostenimiento de las vueltas