Se cree que su existencia se inicia con los iberos y celtíberos, ya que se han hallado vestigios de su construcciónes y utensilios, e incluso se han encontado
mosaicos y ánforas
romanas en "La Covatilla", aunque su fundación documentada, se inicia con la tribu de los Olcades, indómitos guerreros, que contribuyeron a la derrota de Viriato.
Con la invasión árabe, se transforma en tierras de paso y de alternativas conquistas entre musulmanes y cristianos. La creación de la Órdenes
Militares en el siglo XII, se anexionan la villa a la Orden de Santiago.
La Tierra de Alarcón, de realengo durante los siglos XII y XIII, fue incorporada al Señorío de Villena por D. Juan Manuel.
En 1241, cuando D. Gonzalo, Obispo de
Cuenca, por mandamiento de Fernando III, parte términos entre los Concejos de Uclés y Alarcón, ya consta la existencia de núcleos poblados como
Hontanaya, El Congosto (Cuenca) Villar de Cañas (Cuenca),
Los Hinojosos, Mesas Rubias,
Fuente del Espino y algunas aldeas en torno a Haro.
La villa en 1353, formo parte del Común de la Mancha, junto con Villamayor, la Puebla de Don Fadrique, Quintanar,
Villanueva de Alcardete, Miguel Esteban,
Campo de Criptana, Pedro Munoz,
Mota del Cuervo,
Santa Maria de los Llanos, y las tierras hasta Guadiana (Socuéllamos y Tomelloso).
Pero el fulgurante poderío del Marqués de Villena, divide el asentamiento en dos mitades, pertenecientes una, a la Orden de Santiago y la otra, queda anexionada, en el siglo XIII, al Marqués de Villena, cuyo hijo el infante D. Juan Manuel, cotribuyó al explendor de la literatura castellana. La extición del Marquesado de Villena, la derrota de Juana la Beltraneja, y la derrota de los Comuneros, hacen que la villa se integre definitivamente en la corona de Castilla.
En el siglo XVIII perteneció a la provincia llamada de la Mancha, y no a la de Cuenca. No es hasta las reformas liberales de 1833 donde pasa a formar parte de la provincia conquense.
En la actualidad es un solo
pueblo, con un solo
ayuntamiento, resultado de la unión de los dos
pueblos existentes, llamados Hinojoso del Orden, que pertenecía, como ya se ha dicho anteriormente, a la Orden de Santiago, e Hinojoso del Marquesado, perteneciente al Marquesado de Villena (Circular de 29 de agosto de 1841 por la que don Baldomero Espartero, regente del Reino, dispuso que El Hinojoso de la Orden y El Hinojoso del Marquesado formasen un solo pueblo con el nombre de Los Hinojosos)
Personajes: Fray Francisco De Jesús que ejerció su apostolado en el Nuevo Mundo, natural de Hinojoso del Maquesado.
D. Francisco Izquierdo Tavira O. P. nacido en Hinojoso del Orden el 4-10-1686 y fallecido el 6-01-1762, obispo que fué de
Lugo, según se refleja en
Alonso López de Hinojosos (Los Hinojosos, Cuenca, 1535 -
México, 1597),
médico español que ejerciera su profesión en el México colonial.
Fuente: "Mis Recuerdos" Ed. H. de H. 1941 Cesáreo Fraile Izquierdo.
Nota sobre el Marquesado de Villena: Según he leido en "Crónicas de un pueblo, Los Hinojosos", y confirmado por libros sobre el reino de Castilla, doña Blanca Manuel, heredó Señorío de Villena a la muerte de su padre, don Fernando Manuel. Doña Blanca murió muy
joven. El Señorio pasó a su tía paterna, doña Juana Manuel, casada con don Enrique, conde de Trastámara, hijo del rey de Castilla, Alfonso XI, y de su amante doña Leonor de Guzmán. Declaró la guerra a Pedro I, hijo legítimo y heredero de Alfonso XI y, tras muchas vicisitudes, le dio muerte en los
campos de Montiel, siendo proclamado rey de Castilla con el nombre de Enrique II, "el de las mercedes", por las muchas recompensas que hizo a los que habían combatido a su lado. Entre ellos estaba Alfonso de
Aragón, para el cual creó el Marquesado de Villena y le entregó las tierras del antiguo señorío de Villena que su esposa, doña Juana, había heredado de su sobrina doña Blanca.