Ante la resistencia de la ciudad de Zaragoza, la Junta Suprema envía al general Palafox los días 29 y 30 de junio sendos Oficios instándole a volver inmediatamente a la ciudad, regresando el general el día 1 de julio, sustituyendo a su hermano el marqués de Lazán, que estaba a cargo de la defensa. A lo largo del mes de julio las tropas francesas continuaron bombardeando la ciudad, a la vez que poco a poco iban ocupando los puestos exteriores de la defensa zaragozana, mientras que Palafox, aprovechando las escasas defensas que se habían preparado, establecía un Plan de defensa y método que debían de observar los comandantes de puesto en caso de ataque, en el cual se indican los principales puntos de defensa, como Santa Engracia o Puerta del Carmen, lugares donde todos los días se producían combates.