El término "
Chozas de Canales" se deriva del nacimiento de la población: vecinos de Canales construyeron chozas donde posteriormente se edificaría el
caserío.
Se creó tras una epidemia de peste, con gente procedentes de el poblado de Rocanales.
La gente construyó chozas
rio arriba huyendo de la enfermedad.
En el siglo XVII Pedro Coloma y Escolano, secretario de estado de Felipe IV
compra la zona que comprende los despoblados de Canales y Regachuelo, y las villas de Chozas y
Yunclillos. En 1680 se le concedió el vizcondado de Canales y Chozas e instituyó un mayorazgo con estas y otras tierras. Un siglo después, al extinguirse los herederos pasó a manos del obispado de Calahorra y La Calzada. A finales del siglo XVIII aún se conservaba el
palacio marquesal.
A mediados del siglo XIX tenía 148
casas y el presupuesto municipal ascendía a 12.000 reales. La producción agrícola consistía en trigo, cebada, algarroba, aceite y vino.