En esa inhóspita carretera (hasta llegar al río Ebro) que conduce de Burgos a Villarcayo, pasado Peñahorada, a orillas del río Homino, que le da nombre, en terreno llano, se encuentra situado HONTOMÍN, a 21 Km de Burgos.
Forman corona a su alrededor, Cobos junto al Molina, Quintanarruz, Lermilla, Abajas, el despoblado de Quintanajuar, Quintanilla Sobresierra, Quintanarrío, Robredo Sobresierra y Villalbilla Sobresierra.
Era lugar de realengo, es decir, gozaba de la protección del rey, según las contestaciones de sus pobladores en las respuestas generales de Catastro
del Marqués de la Ensenada en 1752 y aparece muy pronto su nombre escrito el 3 febrero de 945 en el cartulario de San Pedro de Cardeña87 y el 24 noviembre de 978 en el documento fundacional del Infantado de Covarrubias.
En el año 1848 contaba con 200 pobladores, según testimonio de Pascual Madoz en su Diccionario geográfico. En línea con la inmensa mayoría de los
pueblos de la provincia, creció a lo largo de la segunda mitad del siglo XIX y presentaba en 1900 un censo de 311 habitantes. Mantuvo bastante bien su
población en la dura primera mitad del siglo XX, pues habitaban en lugar 302 personas en 1950. Y ha notado los efectos de la emigración de la segunda
mitad del siglo, que lo han dejado reducido a 65 habitantes en el año 2000.
En el siglo XI aparece dependiendo de la abadía de Oña y en el año 1190 el rey Alfonso VIII le concede fueros y exenciones.