En la parte central del valle de Losa, un poco apartado a la izquierda de una carretera que une Medina de Pomar con Quincoces de Yuso, en una hondonada y en terreno desigual, está situado NÁVAGOS, a 20 Km de Villarcayo y 95 de Burgos.
Lo rodean formando corona a su alrededor Gobantes, Momediano de Losa, Villaventín y Villalacre al otro lado de los montes, Rosío, Villamor y Villate de Losa.
En el llamado Libro de las Behetrías, fruto del censo-pesquisa que el rey Pedro I manda hacer en toda Castilla en 1352, encontramos por primera vez escrito su nombre.
Gozaba de la protección del rey, es decir, era lugar de realengo, según declararon sus pobladores en 1752 en las respuestas generales del Catastro del Marqués de la Ensenada.
Ha seguido los mismos pasos que la inmensa mayoría de los pueblos de la provincia, en cuanto a su población. Contaba con 45 habitantes en 1848, según consta en el Diccionario geográfico de Pascual Madoz. Creció a lo largo de la segunda mitad del siglo XIX hasta llegar a 131 en el año 1900. Comenzó su declive en la dura primera mitad del siglo XX y presentaba en 1950 un censo de
71 personas. Y, después de los estragos de la emigración de la segunda mitad del siglo, lo termina con 15 habitantes en el año 2000