Los sepulcros, la cubierta, y los muros decorados con sargas hispano-flamencas, representan diferentes escenas de la Pasión y la Resurrección de
Cristo, constituyendo una obra única en
España. Argaiz atribuye la obra a la época de Fray Juan Manso, abad del
monasterio, que comenzó su mandato por los años de 1495. La
bóveda de la
capilla mayor, una estrella de ocho puntas de 1450, es obra de Fernando Díaz de Presencio, siguiendo las trazas de Juan de Colonia.