Su nombre, según el profesor Guillermo Tejada, se debería en origen a un
monasterio o eremitorio dedicado a
San Juan -seguramente el Bautista-. Y a la repoblación por un grupo vascófono que hará que de San Juan se pase a "Santibañez", desde "Sant Ioannnes" > "SantIuannez" > "SanIvannez" > "Santibáñez". En sus primeros tiempos, según los documentos, se usaron los 2 nombres, el romance y el euskerizado. Más tarde, posiblemente entre los siglos XVI y XVII, se le añadió el diferenciador de Esgueva", en clara referencia al
río y a su
valle: Este hidrónimo, seguramente surgido en la Edad Media en la ciudad de
Valladolid, en principio con el significado de "río de cauce dividido en dos", al que se le añadirán el de "río negro o sucio" o "río encauzado"...