El Río Moradillo​ es afluente del Rudrón, uniéndose con éste en Covanera.
Recibe aguas en el Páramo de Masa desde pueblos como Villalta, Quintanaloma, Masa, Moradillo, Mozuelos, Sedano, Gredilla, Nocedo y Covanera.
Después de su nacimiento discurre por el vallejo de Valdeloma donde se van juntando diversos manantiales y fuentes que poco a poco van incrementando el caudal.
En Quintanaloma recibe el arroyo de Horadada, arroyo de Peracho, y arroyo de la Graja. También arroyo de Ruyuela y el arroyo Pardo que viene desde Masa.
También casi desde Masa parte el arroyo de la Vega que se junta con arroyo de la Rina que ha formado un largo vallejo por el que discurre la carretera BU-514. También recibe aguas del río Mozuelos.
Entre Moradillo y Sedano, el valle se ensancha entre Peña Mancería y macizo de Peñaparral. Posteriormente se ven diversos barrancos como Vallimandora, Herreruelos, Hozabarre y Barrancalejo.
Atraviesa Sedano y recibe las aguas de los arroyos de Gredilla como Fuente Hernando y Valdepuente. Después de este pueblo desembocan en él diversos arroyos y fuentes.
Ya en dirección de Covanera entre otros recibe aguas de Valderroban, y arroyo Valdescañillo procedente de Nocedo. También Valtubilla, El Santillo, y Briniega ya en Covanera