Villalonquéjar, popularmente también recibe el nombre de Villalón, es un barrio burgalés, situado al oeste de la capital del municipio, en la confluencia del río Arlanzón con su afluente, el Ubierna, perteneciente a la comarca de Alfoz de Burgos.
Aparece su nombre escrito por primera vez en el año 1080 en el cartulario de San Pedro de Cardeña, como “Villa de Nuño César”.
Lugar que formaba parte, del Alfoz y Jurisdicción de Burgos en el partido de Burgos, uno de los catorce que formaban la Intendencia de Burgos. Tenía jurisdicción de realengo con alcalde pedáneo.
Su iglesia está dedicada a Santa María Magdalena. Se trata de un templo renacentista de una nave, con ábside rectangular, portada de arco de medio punto, bajo pórtico cerrado y torre en espadaña.
Es una zona de gran importancia económica, ya que alberga el polígono industrial de Villalonquéjar, uno de los más grandes de la provincia. Iniciado en la época de los Planes de Desarrollo, ha sido ampliado sucesivamente hasta alcanzar las localidades de Villatoro y Quintanadueñas.
El entorno de Villalonquéjar es característico de la meseta castellana, con amplias llanuras y campos de cultivo, muy cerca del río Arlanzón, que ofrece bonitos paisajes naturales para disfrutar.