Dominando todo el pueblo está situada su iglesia, dedicada a san Esteban, protomártir. (Anteriormente hubo otra iglesia dedicada a San Miguel). Es renacentista, de una nave con capillas en cruz latina, posteriores. Tiene bóvedas de crucería, excepto las capillas y coro, columnas y nervios. La cabecera es muy poco profunda. Por lo que tiene un breve ábside rectangular con contrafuertes en esquinas y alero moldurado. (Da la sensación de que se hundió y ha sido reedificado.). La portada es renacentista con cuatro arquivoltas, y arco rebajado y con decoración en el lugar de los capiteles, bajo pórtico cerrado con arco de medio punto con pilastrones y frontón y rejas de hierro.
Y la torre es cuadrada, sólida, a la que se le ha añadido posteriormente una espadaña de dos cuerpos con remate de bolas y frontón, con dos campanas y dos campanillos.
La pila es de copa lisa con molduras en parte inferior; y el retablo mayor es rococó de 1780, con pinturas.
Sus libros parroquiales comienzan en el año 1653.
El 26 de abril de 1867 nace el Padre Marcelino Arnaiz, agustino, Provincial de su Orden, profesor, filósofo y prolífico escritor, muy apreciado por Menéndez Pelayo y el Cardenal Mercier.
El 20 de marzo de 1871 viene a la vida el padre Benito Ibeas, agustino, misionero en Filipinas y China, escritor.
El 12 de enero de 1883 ve la luz Benito Alcalde González, agustino, martirizado en Paracuellos del Jarama el 8 de noviembre de 1936 y beatificado el 28 de octubre de 2007.
El 12 de marzo de 1883 comienza sus días el padre Benito Alcalde, agustino, Licenciado en leyes, escritor.
Por sus tierras pasaba la calzada romana “Ab Astúrica Burdigalam”.
Y están catalogados en sus tierras un yacimiento arqueológico Medieval; otro de época sin determinar posiblemente Medieval y otro posiblemente Medieval (en el Soto, ermita de la Virgen de Cesilla).
Recientemente, en 1998, han aparecido restos del Calcolítico, tumbas y res-
tos humanos.

Villayerno y Morquillas, dos parroquias distintas: anacronismo que se mantiene desde el siglo XV en el que ambos pueblos se unieron en uno solo.

Pueblo a 8 kilómetros de la capital en la comarca de Alfoz de Burgos, carretera de Poza. Coronando Villayerno Morquillas está la iglesia gótica de san Esteban protomártir, del siglo XVII y una sola nave, construida en piedra con bella espadaña. En su interior cabe destacar la pila bautismal.

Falso. La iglesia está dedicada a San Esteban Protomártir.