Entre sus distinciones más reconocidas destaca el haber sido elegido como mejor defensa de la Liga de Campeones de la UEFA en 2006 y posee el récord de haber sido seleccionado en cinco ocasiones al equipo ideal de la UEFA en los años 2002, 2005, 2006, 2008 y 2009.[5] También ha sido incluido en el Equipo del año por la FIFPro en dos años consecutivos: 2007 y 2008. Fue seleccionado por el diario The Sun como uno de los cuatro mejores defensas de la década en el 2009[6] y la FIFA lo ha seleccionado en dos ocasiones para formar parte de su equipo ideal tras la Eurocopa de 2008 y la Copa Confederaciones de 2009.
En 2009, Puyol se convirtió en el primer capitán en la historia del FC Barcelona en levantar seis copas en un mismo año (Liga, Copa, Supercopa de España, Liga de Campeones, Supercopa de Europa y Copa Mundial de Clubes. Actualmente, Puyol ha ganado 12 títulos con su club y un título europeo con la Selección de España.
Por todos estos logros con su club, con la Selección española y por sus distinciones logradas Puyol es considerado por la prensa y por diversos entes deportivos como uno de los mejores defensas centrales del continente y del mundo.[7] [8] [9] [10] [11]
En una entrevista realizada por el diario español As al ex jugador italiano Franco Baresi (considerado como uno de los más grandes defensas en la historia)[12] éste definió a Puyol como un jugador de élite y dijo que es uno de los mejores del mundo
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