Museo de
Arquitectura. Estaba situado en los sótanos del
edificio, en la llamada por Juan de Herrera Planta de
Bóvedas, y fue creado en el año 1963 como parte de las
exposiciones del IV centenario de la colocación de la primera
piedra. En sus once salas se mostraban las herramientas, grúas y demás material empleado en la construcción del
monumento, así como reproducciones de planos, maquetas y documentos relativos a las obras, con datos muy interesantes que explicaban la idea y gestación del edificio. Estas salas fueron cerradas definitivamente en 2015.