Dada su altitud media, 1.200 metros, su climatología es continental de alta montaña, con una temperatura media anual de 11º, que oscila entre una máxima de 40º en verano y una mínima de -10º en invierno. Además, las lluvias y el deshielo de la montaña hacen que Navacerrada cuente con mucha actividad pluvial. Así, encontramos el Río Navacerrada, los arroyos de La Maliciosa, del Chiquillo y de los Navajeros, y las Presas y y II de La Barranca, la del Chiquillo y la de los Almorchones, además del embalse principal.