A partir de 1312, la villa de Frexenal volvió a engrosar los territorios del reino de
Sevilla, a la vez que formaba parte de la diócesis de
Badajoz. En 1833, tras 585 años de existencia, el Real Decreto de 30 de noviembre suprimió el reino de Sevilla, creando las actuales provincias de Sevilla,
Huelva y
Cádiz; e incorporando a Fregenal a la provincia de Badajoz.