En el siglo xv su jurisdicción se extendía a tres lugares Higuera, Bodonal y Marotera. Curiosa era la situación jurisdiccional tripartita de Fregenal, puesto que en lo espiritual siempre perteneció al Obispado de Badajoz, siendo al mismo tiempo encomienda de la Orden de San Juan de Jerusalén que tras la desaparición del Temple se había quedado con parte de sus bienes. De esta manera perteneció en lo espiritual a Badajoz, en lo decimal a la Orden de San Juan y en lo terrenal al Concejo de Sevilla.