En el año 713 la ciudad cayó en manos musulmanas, los cuales la convirtieron en capital de la Cora de
Mérida. Los mozárabes emeritenses se rebelaron repetidamente contra la autoridades califales en el siglo IX y la ciudad comenzó un lento declive. Mérida fue reconquistada por las tropas cristianas de Alfonso IX de
León en 1230. En reconocimiento a su pasado esplendor, en 1983 fue designada capital de la comunidad autónoma de
Extremadura. La cora era una de las demarcaciones territoriales en que estaba dividida al-Ándalus, la antigua península ibérica islámica, durante el emirato y el califato de
Córdoba. Coexistía con otra demarcación territorial denominada Marca ("thagr"), que se superponía a las coras en las zonas fronterizas con los reinos cristianos. Ambas constituían la organización territorial andalusí. Mozárabe es el nombre con el que se conoce a la población cristiana, de origen hispanovisigodo, que vivía en el territorio de al-Ándalus y que, como los judíos, gozaba del estatus de dhimmis ('protegidos') al ser gentes del Libro. El término «mozárabe» no fue empleado por los musulmanes sino por los cristianos de los reinos del norte para designar a los cristianos de Al-Ándalus que emigraban a sus territorios; este nombre indica que los mozárabes habían tomado usos y
costumbres de sus dominadores árabes, incluyendo el conocimiento de la lengua árabe. [cita requerida] Así la palabra «mozárabe» no aparece en los textos árabes sino en los cristianos: el primer documento en que se ha constatado su uso es del reino de León y está fechado en 1024. Se denomina Reconquista al período en la
historia de la península ibérica de aproximadamente 780 años entre la conquista omeya de Hispania en 711 y la caída del Reino nazarí de
Granada ante los reinos cristianos en expansión en 1491. La conquista completa de Granada fue el contexto de los viajes españoles de descubrimiento y conquista de América, el "Nuevo Mundo", que iniciaron
la era de los imperios español y portugués. Colón obtuvo el apoyo real en Granada en 1492, meses después de su conquista. Alfonso IX de León fue el último rey de León como reino independiente, desde 1188 hasta su muerte en 1230. Su hijo Fernando III de León y de Castilla une definitivamente los reinos de León y de Castilla en 1230.