Subijana de Álava está 14 km al suroeste de la ciudad de Vitoria. Se sitúa en las estribaciones de los montes de Vitoria, a media ladera (568 metros de altitud) y cerca del nacedero de un afluente del río Zadorra. Es el concejo más occidental de los que pertenecen al municipio de Vitoria. Limita al oeste y al norte con el municipio de Iruña de Oca, al sur con el Condado de Treviño y al este con el concejo de Zumelzu. La autovía A-1 pasa a 2,5 km del pueblo.